虽然台日之间关系暧昧，但在海上渔业等资源方面也是矛盾重重，时不时有台籍船只遭到日舰驱逐。10月3日台媒爆料称，今年9月台湾大学“新海研1号”研究船在东部海域进行科考研究，毫无疑问又被日本海上保安厅给盯上。日方出动巡逻舰进行骚扰，不堪其扰台研究船寻求“海巡署”帮助，“海巡署”随后出动花莲舰及海巡舰前往护航，双方进行了长达10小时对峙，最终还是台研究船先走日巡逻舰才撤开。

　　这个区域在花莲港东南方69海里处，属于台湾明确所有的“专属经济海域”，不过对于日本来说都是自己的。由于传统上日强台弱，虽然这次执法船数量上两比一，而且对峙超过10小时。但台巡逻舰并没有达到驱离的目的，我们对比海警船及海巡署和日本保安厅的对