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台湾立法院助理秦生在其谈台湾法务部调查局的东网专栏文章中说：“调查局前身可朔自1928年北伐末期成立的“国民革命军总司令部密查组”，为中华民国最早的情报调查组织；1932年，“国民政府军事委员会调查统计局”（简称“军统局”）成立，1937年对日抗战爆发，军统局重组，第一处改为“中国国民党中央执行委员会调查统计局”（简称“中统”），……”

“中统”的起源还要复杂一些。1928年初，国民党中央组织部中设立专职情报的党务调查科。1932年，党务调查科扩充为特工总部，对外仍用旧名。1935年，特工总部/党务调查科改名为党务调查处。1937年4月，党务调查处与三民主义力行社特务处（力行社是中华复兴社/蓝衣社的秘密核心组织，后者是一些黄埔系国军高官创建的拥戴蒋中正的纳粹主义风格的团体）合并为国民政府军事委员会调查统计局（军统）。原党务调查处为军统第一处负责党务情报，原力行社特务处为军统第二处负责特别任务。1938年3月29日，军统第一处改组为国民党中央执行委员会调查统计局（中统，隶属于中央党部秘书处）。

1947年4月17日，中统改名为中国国民党党员通讯局（党通局）。1949年5月，党通局主要职能部分改组为行政院内政部调查局，但仍由国民党中央掌控。1955年，调查局接收国防部军事情报局的保防侦查等业务。1956年6月1日改隶于司法行政部，1980年8月1日，随司法行政部更名为法务部而更名为法务部调查局。

调查局的职权重点是维护台湾安全和打击社会重大犯罪活动。调查局除接受国家安全局委托的“政治侦防”业务外，还要负责查贿、缉毒、防止重大经济犯罪等。

调查局在台湾情报机构中可算老三。老二是国防部军情局，专责执行战略预警情报搜集、研整任务，隶属于国防部参谋本部，接受参谋总长指挥。

军情局的前身是大名鼎鼎的军统。1928年北伐末期，国民革命军总司令部设立密查组，蒋中正总司令特令戴笠负责主持军事情报调查搜集。1931年，力行社下设特务处，从事情报暗杀活动，处长是戴笠。上面说过，1937年4月，力行社特务处与国民党中央组织部党务调查处合并为国民政府军委会调查统计局。1938年3月29日，军统第二处（原力行社特务处）扩编为军统，隶属于军委会办公厅。1946年军统局长戴笠死后，军统改组为国防部保密局，专责保密防谍。原有公开特务武装部分与军委会军令部二厅合并为国防部第二厅。1955年，保密局改组为国防部情报局，专责执行战略预警情报搜集、研整任务。保防侦查等业务拨归司法行政部调查局接管。1985年7月1日，情报局与负责渗透大陆的国防部特种情报室合并为军情局。2013年1月精粹案规划后，军情局情报业务接受参谋本部联二情报次长室督导，不再受国家安全局指挥。

台湾情报机构的老大是国家安全局，主要负责国家安全情报、特种勤务策划执行、统筹密码管制研发，是总统主持的国家安全会议的唯一附属机构。

国安局的三大任务具体说来是：

（1）综理国家安全情报工作：掌握国际情报、大陆地区（中华人民共和国）与中国人民解放军情报、台湾地区（中华民国）安全情报，国家战略情报分析、科技情报电讯研发工作。可以统整、指挥、协调情报机构（军情局、调查局、国防部参谋本部电讯发展室、国防部军事安全总队等）和警察机构（内政部警政署、行政院海岸巡防署）以及军事警察机构（国防部宪兵指挥部）。

（2）特种勤务策划执行工作：负责维护正副总统、卸任正副总统、选举时期的总统候选人人身安全。

（3）统筹密码管制研发工作：依政府机关密码管制等政策行事，借由政府密码管制机制，建立绵密资通保密网络。

国安局始于1949年8月20日。当时已辞任民国总统的蒋中正以国民党总裁身份在台北市圆山设立“政治行动委员会”，以统合国军、国民党和国民政府各情报机构。蒋中正于1950年复任总统后，政治行动委员会改名为总统府机要室资料组，主任是蒋经国。1954年10月，总统府机要室资料组改组为中华民国国家安全局（早期也称为“中国CIA”或“CCIA”），隶属于国防会议。1955年，国安局成为各情报机构的最高统筹机关，对各情报机构负有督导、考核、指导和协调作用，并负责对外国际情报工作。1967年2月1日，国防会议裁撤。1967年2月16日，动员戡乱时期国家安全会议成立，国安局随之改隶。1993年12月30日《国家安全会议组织法》及《国家安全局组织法》公布后，国家安全局于1994年1月1日法制化。